Filmas "Labirinta skrējējs" turpinājuma sākumā Tomass (Dilans O'Braiens) un pārējie izdzīvojušie meklē norādes par kādu noslēpumainu, ietekmīgu organizāciju. Drīz vien viņi nonāk svelmainā tuksnesī, kas ir pārpilns ar neiedomājamiem šķēršļiem, kā arī tur viņus gaida...
Divdesmit četri no septiņdesmit pieciem vīriešu kārtas studentiem tika izvēlēti, lai eksperimenta laikā iejustos cietumnieku un cietuma apsargu ādā simulētā cietumā, kas atrodas Stenfordas Psiholoģijas fakultātes pagrabā.